需要具备运行稳定的制冷系统和足够的制冷量。市面上冷冻式干燥机大多使用的都是制冷压缩机，一般都使用的高温型全密封往复活塞机。一般的大型冷冻干燥也会采用半封闭往复式压缩机或者螺杆制冷压缩机。对于制冷压缩机要求其制冷量需要一直大于冷冻干燥机蒸发器热负荷，否则就没办法满足极端工况下压缩空气的处理要求。
充分热交换，其核心是有足够大的换热面积。在蒸发温度一定条件下，蒸发器换热面积对于压缩空气最终温度影响最大。当换热面积越大空气最终温度就与蒸发器温度温差越小。理论来说只要蒸发器换热面足够大，压缩空气最终冷却温度就可以在管内冷媒液体蒸发温度高3-5℃。
在用气过程中需要确保管道和设备不会发生或者尽可能减少二次蒸发现象，引起二次蒸发是因为冷却后的气体在水分不能被完全分离出来导致，当气体温度升高以后残留水分又会蒸发到气体中并影响干燥效率。因此在冷冻干燥过程中需要配套一个高效油水分离器，常见的油水分离器主要采用的是板式分离器、过滤式分离器一级旋风分离器。
